Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms