Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORCS2Q96PQ0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms