Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms