Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC7Q96M83 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms