Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCZQ96LD1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCZQ96LD1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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