Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEURL4Q96JN8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms