Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms