Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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