Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJA3Q96EY1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms