Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms