Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C18orf8Q96DM3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms