Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAF2Q96CS3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms