Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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