Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms