Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms