Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A1Q93096 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms