Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PRG4Q92954 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms