Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF4BQ92750 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms