Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113Q902F9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113Q902F9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms