Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms