Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRSK1Q8TDC3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRSK1Q8TDC3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms