Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3C3Q8NEB9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms