Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLDN19Q8N6F1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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CLDN19Q8N6F1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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CLDN19Q8N6F1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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CLDN19Q8N6F1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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CLDN19Q8N6F1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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