Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 AL358176.4-201ENST00000428891 675 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 IL4-201ENST00000231449 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00528Q8N1L1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms