Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP1Q86WV1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms