Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms