Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2Q1Q7Z7E8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms