Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEND4Q6ZU67 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms