Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms