Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms