Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms