Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms