Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPH2Q6IBW4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms