Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUPD1Q68J44 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms