Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLX4IPQ5VYV7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms