Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHSL1Q5SYE7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms