Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms