Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms