Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms