Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms