Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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