Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms