Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms