Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms