Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ISXQ2M1V0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms