Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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NDUFA9Q16795 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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NDUFA9Q16795 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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NDUFA9Q16795 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFA9Q16795 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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