Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTRK2Q16620 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms