Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF239Q16600 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ZNF239Q16600 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ZNF239Q16600 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ZNF239Q16600 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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ZNF239Q16600 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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