Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNAPC1Q16533 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms