Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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DDB1Q16531 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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DDB1Q16531 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
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DDB1Q16531 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDB1Q16531 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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